《吉林医药学院学报》（双月刊）创刊于1979年，由吉林医药学院主办。本学报为在国内外公开发行的医药卫生类综合性学术期刊。主要反映学院在医学科研、医疗、教学方面的新成果、新技术、新经验，内容包括基础医学、临床医学、预防医学、药学、医学检验、营养学、护理学、卫生管理等，栏目设置有论著、经验交流、技术。

《吉林医药学院学报》1999年获全国医学期刊质量评比一等奖。